除了基礎研究工作，本中心亦擔負重要之社會責任，包括：(1) 推動台灣之生物多樣性之保育與教育工作；(2) 以豐沛的學術動能將生物學、生物科技、環境生態及社會經濟融入研究主題；以及(3) 推動生物多樣性之科普教育及環境生態之永續發展。台灣島嶼雖小，陸地面積僅佔全球萬分之三 (0.03%)，但動植物種類卻高達全球物種數的2.6%；其中更有相當大的比例是台灣特有種。主要原因是台灣的生態系統極為多樣，包括高山、亞熱帶，熱帶、河口濕地及珊瑚礁生態系等；台灣島又地處多個重要洋流的交會之處。故保育台灣島嶼及周邊海域之動植物種類及維護其棲地之完整，即能對全球之生物多樣性之維護有重大的貢獻。